繼本科課程，工程學院於2019至20年度開辦金融科技理學碩士課程，首屆名額約五十個。課程由人工智能、網絡安全及金融工程學等範疇的專家設計和任教，內容涵蓋金融基建、電子支付系統、量化交易和算法交易、互聯網金融以及金融信息學等。