研究所

人文學科研究所

人類傳意科學研究所

中國文化研究所

中國科學院香港中文大學深圳先進集成技術研究所

中醫中藥研究所

太空與地球信息科學研究所

心腦血管醫學研究所

未來城市研究所

生物科技研究所

光科技研究所

全球經濟及金融研究所

呂志和創新醫學研究所

李嘉誠健康科學研究所

材料科學及技術研究中心

亞太工商研究所

亞洲供應鏈及物流研究所

信興高等工程研究所

香港中西醫結合醫學研究所

香港亞太研究所

香港教育研究所

香港糖尿病及肥胖症研究所

香港癌症研究所

消化疾病研究所

深圳研究院

理論物理研究所

理論計算機科學與通訊科學研究所

植物分子生物學及農業生物科技研究所

經濟及金融研究所

精密工程研究所

網絡編碼研究所

數學科學研究所

環境、能源及可持續發展研究所

截至2013年10月30日