中大於國家教育部頒發的2011年度高等學校科學研究優秀成果獎（科學技術）中，共獲六項殊榮，包括三項自然科學獎一等獎、兩項科技進步獎一等獎及一項科技進步獎二等獎，獲獎數目為全港之冠。頒獎典禮於3月29日假逸夫書院大講堂舉行，國家教育部科技發展中心副主任周靜博士親臨向中大頒贈證書，由沈祖堯校長代表接受。得獎名單及研究項目如下︰

• 自然科學獎一等獎︰
  黃家星教授、莫仲棠教授、梁慧康教授、陳向燕博士和余俊豪教授 ─「顱內大動脈病變腦卒中的流行病學、診斷、發病機制、影像學和治療」；
  王鈞教授─「神經動力學優化模型及應用」；
  陳漢夫教授─「解Toeplitz系統的迭代法及其應用」
• 科技進步獎一等獎︰
  余卓文教授、陳日新醫生、林逸賢教授、李沛威教授、張慶教授和房芳教授─「超聲心動圖技術在心力衰竭預防、診斷、治療、預後中的創新應用」；
  王毅翔教授、梁湛輝教授─「磁共振分子影像和功能影像研究和應用」
• 科技進步獎二等獎︰
  陳家亮教授、劉潤皇教授、沈祖堯校長和趙偉仁教授─「消化性潰瘍出血防治的療法創新和技術改革」。